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一、培養目標
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二、研究方向
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1、 水生生物技術 2、 水域生態學
3、 漁業生態環境評價與保護 4、 水生生物資源與利用
5、 水生生物遺傳育種
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三、學制及學習年限
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基本學制為三年。
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四、學分要求
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博士生一般應在入學后一年半內完成至少15學分。以同等學力錄取的博士研究生應補修至少2門本學科碩士必修課程,不計學分。提前攻博生或碩博連讀生總學分要求原則上在36學分以上。
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五、必修環節
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研究班討論 2學分。（學術交流（要求選聽專業學術講座至少6次考查）
學術活動和學術會議（ 要求參加本學科領域學術研討活動至少3次并做至少2次學術報告；參加本學科領域重要的學術會議并宣讀學術報告至少1次。））共2個學分
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六、學位論文
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學位論文工作是研究生培養的重要組成部分，是對研究生進行科學研究或承擔專門技術工作的全面訓練，是培養研究生創新能力、綜合運用所學知識發現問題、分析問題和解決問題能力的主要環節。
博士研究生學位論文答辯及學位申請工作包括預答辯資格的申請、預答辯、答辯資格的申請、論文（雙盲）評閱、答辯、學位授予及學位公示等環節。其具體要求依據《南京農業大學研究生學位論文答辯及學位申請工作暫行規定》及相關補充規定執行。
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七、思想政治工作
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研究生思想政治教育是研究生培養的重要組成部分。學院不僅要重視研究生的業務知識、工作能力的培養，使他們具有合理的知識結構和能力結構，更要重視不畏艱難的科學作風、嚴謹求實的優良學風、求新探異的創新意識、艱苦奮斗的創業品格、合作溝通的團隊精神等諸方面素質的培養。建立健全各項管理制度，充分發揮基層研究生黨、團組織和研究生會及研究生社團在研究生思想政治教育中的主體作用，不斷提高研究生自我教育、自我管理和自我服務的能力。
導師要從思想、學風等各方面為人師表、以身作則，做到教書育人、嚴格要求。導師負有對研究生進行思想政治教育的首要責任。導師在研究生思想政治教育中要充分發揮其突出作用。導師要善于在學術活動中融入研究生思想政治教育內容，促進研究生的學術科研能力和思想道德素質同步提高。
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八、中期考核
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博士生在第四學期內進行中期考核，根據其課程學習的學分是否滿足要求及是否具有培養前途，決定是否進入學位論文階段。具體按研究生院有關規定執行。
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九、開題報告
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研究生的開題報告原則上在中期考核前完成，開題報告審核通過后至少一年方可申請答辯。通過博士生資格認定的碩博連讀生開題報告原則上在第六學期前完成，且開題報告審核通過后至少一年方可申請答辯。
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