近日,淡水漁業(yè)研究中心徐跑研究員領(lǐng)銜的課題組以新品種——吉富羅非魚“中威1號”為材料,開展了海豚鏈球菌感染下羅非魚Mirna介導(dǎo)靶基因的調(diào)控機制研究并取得進展。

圖1 差異表達miRNAs的聚類分析
Mirna是一類小的非編碼RNA,可以通過與一個或多個靶基因3'-UTR結(jié)合來調(diào)節(jié)靶基因表達活性。成熟的Mirna廣泛存在于動物、植物與病毒中,主要參與了哺乳動物先天性免疫應(yīng)答、炎性疾病、細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與代謝的調(diào)控過程。相比之下,魚類方面的Mirna研究起步較晚,Mirna在魚體內(nèi)的信號通路及其調(diào)控機制的報道也較為有限。
 圖2 差異表達miRNAs的QRT-PCR驗證
該項研究基于Mirna組學(xué)技術(shù),成功構(gòu)建了鏈球菌感染24h后的差異Mirna表達文庫,篩選了19個顯著差異表達的Mirna,8個Mirnas(miR-92, miR-101c, miR-310-3p, miR-127, let-7, miR-599, miR-122-5p 和 miR-10d-5p)顯著上調(diào);11個Mirnas(miR-92d-3p, miR-146-3p, miR-17-5p, miR-10, miR-694, miR-181b, miR-138, miR-10-5p, miR-33a, miR-375-5p 和miR-10b)顯著下調(diào)。同時,對這些差異表達Mirnas的靶基因進行了篩選與驗證。實驗證明,海豚鏈球菌感染后的miRNA與其靶基因主要介導(dǎo)了免疫炎性響應(yīng)與細胞因子信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。該項研究結(jié)果不僅在認識應(yīng)激狀態(tài)下魚類分子調(diào)控與細胞信號傳導(dǎo)途徑方面具有重要的理論意義,還將為緩解魚類應(yīng)激損傷提供新的治療靶點與治療策略。
 圖3 潛在靶基因的QRT-PCR驗證
該研究結(jié)果所形成的論文“Effects of exposure to Streptococcus iniae on microRNA expression in the head kidney of genetically improved farmed tilapia (Oreochromis niloticus)”已在BMC Genomics (2017) 18:190上發(fā)表(DOI 10.1186/s12864-017-3591-z)。
(生物技術(shù)研究室 供稿)
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