8月11日，淡水漁業(yè)研究中心水產(chǎn)遺傳育種研究室魚類遺傳項目組在自然集團旗下期刊《Scientific Reports》在線發(fā)表了調(diào)控羅非魚色素形成與分化關(guān)鍵基因的研究成果。
　　羅非魚是淡水漁業(yè)研究中心的重點研究對象。為了豐富羅非魚的種質(zhì)資源和遺傳改良材料，淡水漁業(yè)研究中心2010年從馬來西亞引進了一批紅羅非魚，在紅羅非魚的養(yǎng)殖與選育過程中，發(fā)現(xiàn)紅羅非魚的體色存在很大的變異，除了有粉紅色以外，有些魚的體表會出現(xiàn)超過三分之一的紅斑或黑斑，有些甚至全身都變黑。為探究羅非魚體色分化的機理，淡水漁業(yè)研究中心遺傳育種研究室魚類遺傳項目組通過轉(zhuǎn)錄組學分析，研究了調(diào)控羅非魚色素形成與分化的關(guān)鍵基因，取得了重要進展。
　　在該項研究中，運用Illumina測序技術(shù)首次獲得了粉紅、紅斑和黑斑3種不同體色紅羅非魚皮膚轉(zhuǎn)錄組文庫。測序得到的224,895,758個原始序列中共組裝產(chǎn)生了160,762個參考序列，同時獲得了大量有用的體色相關(guān)的SSRs分子遺傳標記。然后利用各種生物信息學技術(shù)，對組裝結(jié)果進行了功能注釋，包括與其他物種的序列比對，KEGG代謝通路以及GO功能分析等。同時對3種不同體色的皮膚轉(zhuǎn)錄組序列進行了基因表達定量，通過兩兩比對，篩選出148個顯著差異表達的功能基因，其中包括色素合成相關(guān)的許多重要基因，包括tyr、tyrp1、silv、sox10、slc24a5、cbs和slc7a11基因等。在此基礎(chǔ)上，對重要的相關(guān)基因在不同體色的紅羅非魚群體中進行了大數(shù)量的隨機驗證并對紅羅非魚皮膚色素合成通路進行了分析。
　　體色是魚類的重要經(jīng)濟性狀之一，在羅非魚、鯉、黃顙魚等品種中體色差異對經(jīng)濟效益的影響尤為重要。該研究結(jié)果有助于深入揭示紅羅非魚體色分化變異的分子遺傳機制，進而為選育體色穩(wěn)定一致的紅羅非魚品系奠定基礎(chǔ)，同時對其他魚類的體色遺傳研究也具有重要的借鑒意義。
　　研究論文題目為《Comparative Transcriptome Analysis Identifies Candidate Genes Related to Skin Color Differentiation in Red Tilapia》，第一作者為朱文彬助理研究員、王蘭梅博士，通訊作者為董在杰研究員。《Scientific Reports》期刊影響因子5.228。論文網(wǎng)址http://www.nature.com/articles/srep31347。

（水產(chǎn)遺傳育種研究室 供稿）