近日，淡水漁業(yè)研究中心強(qiáng)俊研究員團(tuán)隊(duì)在羅非魚(yú)種質(zhì)資源收集、利用與新材料創(chuàng)制研究上取得新進(jìn)展。
羅非魚(yú)具有生長(zhǎng)快、適應(yīng)性強(qiáng)、經(jīng)濟(jì)價(jià)值高等優(yōu)勢(shì)，在引入后迅速成為中國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖的重要支柱。然而，國(guó)內(nèi)羅非魚(yú)普遍存在親本退化現(xiàn)象，表現(xiàn)為流行病危害大、繁殖力下降等。當(dāng)前亟需系統(tǒng)開(kāi)展野生種質(zhì)資源收集、評(píng)價(jià)和鑒定工作，為羅非魚(yú)種質(zhì)改良提供新的遺傳材料基礎(chǔ)。
為此，團(tuán)隊(duì)依托國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃“政府間國(guó)際科技創(chuàng)新合作”重點(diǎn)專項(xiàng)，開(kāi)展了系統(tǒng)性攻關(guān)。在全球范圍內(nèi)（涵蓋尼羅河流域、西非薩赫勒地帶、中東約旦河流域以及東南亞等主要羅非魚(yú)分布區(qū)）進(jìn)行了大規(guī)模羅非魚(yú)種質(zhì)資源調(diào)查與收集，系統(tǒng)獲取了包括尼羅羅非魚(yú)、紅羅非魚(yú)、薩羅羅非魚(yú)、伽利略羅非魚(yú)、奧利亞羅非魚(yú)及齊氏羅非魚(yú)等在內(nèi)的核心種質(zhì)資源，成功構(gòu)建了系統(tǒng)完善的羅非魚(yú)種質(zhì)資源庫(kù)。
團(tuán)隊(duì)開(kāi)展了不同地理群體尼羅羅非魚(yú)和紅羅非魚(yú)的全基因組重測(cè)序分析，探究不同羅非魚(yú)群體/品種的遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)差異，從基因組水平評(píng)估群體間遺傳結(jié)構(gòu)差異和種質(zhì)特征。建立了不同種質(zhì)資源鑒定技術(shù)，篩選可以區(qū)分不同地理群體/品種的SNPs標(biāo)記，相關(guān)研究?jī)?nèi)容已申請(qǐng)發(fā)明專利1項(xiàng)。
團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新性將深度學(xué)習(xí)算法運(yùn)用于羅非魚(yú)耐鹽堿表型性狀的精準(zhǔn)鑒定，通過(guò)構(gòu)建卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型實(shí)現(xiàn)了性狀特征的精準(zhǔn)識(shí)別與量化分析，相關(guān)研究已申請(qǐng)發(fā)明專利1項(xiàng)；成功鑒定出多個(gè)與速生、耐鹽、耐堿、抗病、易加工等重要性狀相關(guān)的關(guān)鍵位點(diǎn)和基因，建立了羅非魚(yú)高抗育種技術(shù)，相關(guān)研究已申請(qǐng)發(fā)明專利2項(xiàng)；研發(fā)出具有自主知識(shí)產(chǎn)權(quán)的羅非魚(yú)40K基因組育種芯片——“紅芯1號(hào)”，實(shí)現(xiàn)了對(duì)生長(zhǎng)速度、抗逆性等重要經(jīng)濟(jì)性狀的早期預(yù)測(cè)和高效選育，填補(bǔ)了我國(guó)特色淡水魚(yú)全基因組選擇育種技術(shù)的空白。為提升羅非魚(yú)良種選育效率，保障羅非魚(yú)產(chǎn)業(yè)可持續(xù)發(fā)展提供了有力技術(shù)支持。
相關(guān)成果論文發(fā)表于國(guó)際權(quán)威期刊《Food Chenmistry》（JCR一區(qū)，IF 9.8）、《Aquaculture》（JCR一區(qū)，IF 3.9）、《International Journal of Molecular Sciences》（JCR一區(qū)，IF 4.9）上。
全文鏈接：https://doi.org/10.3390/ijms26104910
https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2025.742203
https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2024.742108
https://doi.org/10.1016/j.foodchem.2025.145540
（生物技術(shù)研究室、農(nóng)業(yè)農(nóng)村部羅非魚(yú)遺傳育種中心 供稿）
